Бенджамин Мильпье родился 10 июня 1977 года во французском Бордо. Начал танцевать в восемь лет с подачи своей мамы Кэтрин, которая занималась современными танцами. В 13-летнем возрасте начал учиться в Лионской консерватории классическому балету. В 1992-м был принят в Школу американского балета в Нью-Йорке. Началось всё с летней школы, а на следующий год он начал очное обучение при труппе Городского балета Нью-Йорка, был стипендиатом французского министерства культуры. С 2001-го Мильпье считался ведущим танцором и звездой этой труппы. В 2004-м и 2005-м работал в нью-йоркском Morriss Center Dance Workshop, а в 2006-м и 2007-м был хореографом арт-центра Михаила Барышникова. За свою карьеру Бенджамин успел поработать с известнейшими балетмейстерами (он танцевал в постановках Роббинса, Баланчина, Эйфмана, Прельжокажа и других), выступал в балетах «Лебединое озеро», «Спящая красавица», «Бранденбург» (в постановке Джерома Роббинса), «Времена года» и многих-многих других. Широкую известность Бенджамин Мильпье получил после того, как в 2009 году выступил хореографом в триллере Даррена Аронофски «Чёрный лебедь» и сыграл роль партнёра главной героини, которую исполняла Натали Портман.